产品介绍
由中国有渔业实验学习院生物技木技木学习咨询中心李炯棠学习的团队合作与杭州康普森农产品加工科持有限制集团发掘好几回款最合适于鲤培育、品类签别等少贷款用途的染色体制种存储集成电路芯片
——“鲤育1号”(图2)。该存储集成电路芯片富含了20K个高品质理的SNP位点,为理鱼行业提质创效,培育高质量、高产稳产、耐粗、高抗、耐密等不错特性的理鱼良种苗出示有利的技木承重。
“鲤育一號”进行康普森CAGT(®)靶点获取测序技术设备,包含的16种主养大黑鱼的全什么是表观遗传组组重测序进化和首要区域经济特性微信关联标上。“鲤育一號”IC集成电路基带处理器位点包含全什么是表观遗传组组取舍繁育反应大的位点和包含各种各样大黑鱼目标群体多态性标上。该IC集成电路基带处理器包含的大黑鱼菅养品质质量特性(粗球蛋白、粗油脂、安基酸、油脂酸、肌肉群质构、肌间刺、纹段等)、外周血有效成分及占比、身份证性别等特性的分子式标上18056个,不仅如此还包含辩别16种鲤种类特喜欢的人位点144个,可以用于首要特性的繁育值想大概和种类确权爱护。根据模板IC集成电路基带处理器测评,“鲤育一號”IC集成电路基带处理器,新品牌位点检测出率高,平衡检测出率高于了95.18%,新品牌平稳性好、什么是表观遗传组型准确度高,再次模板平衡分析一致性比率98.77%,新品牌效果优质。
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货品内容
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首要技术指标
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“鲤育二号”制种存储芯片
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标志图片信息
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标志款式
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SNP
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标上数目
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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类型检验位点
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144
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技术设备方式
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康普森CAGT®靶向治疗截获测序的技术
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参考选取dna组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。