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罗氏沼虾
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产品介绍
全国海产品专业论述院珠江海产品论述所惠阳淡水虾遗传的的病繁育的研究规划设计组于凌云院士论述团队的合作与苏州康普森林果科枝是有限的我司的合作,使用康普森CAGT®靶向治疗药物猎取测序技术性,的研究规划设计了具自行内容产权证的罗氏沼虾200K靶向治疗药物猎取繁育单片机芯片“臻珠6号”。“臻珠6号”具什么是基因遗传的组组遍布全面的、费用低、特效好、较准率高等教育性能,可用途于罗氏沼虾遗传的的病复杂化性测评、种质环境自然资源鉴定结论、功能性什么是基因遗传的组收集同时什么是基因遗传的组组的选择繁育等论述,可以是罗氏沼虾遗传的的病种质环境自然资源的规划设计与使用具备2017最新的团伙方法。使用“臻珠6号”可栽培罗氏沼虾的新货种,进步调低研发费用,为栽培发展快、抗病性(逆)强、品质保证优好罗氏沼虾新货种打牢基础框架。
电子器件问题 关键点基本参数 臻珠6号
符号新信息 标注结构类型 SNP
标志占比 200000
模块位点 22
测序类型 各个温带季风气候源头的237只罗氏沼虾
表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
应用方向
罗氏沼虾遗传多样性评估
罗氏沼虾种质资源鉴定
罗氏沼虾全基因组选择育种
罗氏沼虾全基因组关联分析
数据表现
研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点,对这些样本开展了高深度重测序工作,最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上,结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点,最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点,这些位点均匀地分布在59条染色体上(图1),并表现出较高的遗传多样性(图2)。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析,结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致(图3),说明该芯片可较好地代表群体原始状况。
图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布
图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布

图3 不同位点集的进化树结果(上图200K,下图所有位点)