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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观染色体隐性基因规律组低角度重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是运用较低角度（~1×）的重测序统计数据报告信息采取染色体隐性基因规律变种临床表现，此后可以通过表观染色体隐性基因规律型充填，将低比热容统计数据报告信息充填为高比热容表观染色体隐性基因规律型统计数据报告信息。LcWGS 必须机系统发掘，测序费用低，就能了解全表观染色体隐性基因规律组染色体隐性基因规律变种，更有助于于大范围样本量的遗传性状确定及 GS 繁育app。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可赢得全基因组组的遗传基因突变
  • 高性价比
    以不高的测序成本预算低，兑换高硬度的箭头，判断利用率高
  • 大群体
    样本检测
    常广泛用于大群体行为的什么是基因型加测及探析
  • 分型
    准确性高
    由于补充算法流程图，临床表现准确无误率相当于98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质准确定位及GS结杲是比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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