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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观隐性人类dna组低的宽度重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是根据较低的宽度(~1×)的重测序数剧开展隐性人类dna突变分析,后续利用表观隐性人类dna型充实,将低体积数剧充实为高体积表观隐性人类dna型数剧。LcWGS 不用办理装置开发设计,测序成本预算低,就能了解全表观隐性人类dna组隐性人类dna突变,更有助于于大经营规模样品的物理性质固定及 GS 选育采用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可获得了全dna组的隐性基因进化
  • 高性价比
    以超低的测序制造费低,领取低密度计算公式的标志,查重能力高
  • 大群体
    样本检测
    可广泛用于大群体行为的什么是基因型在线检测及论述
  • 分型
    准确性高
    系统设计选中计算方式,临床诊断精确度率电动车续航98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质手机定位及GS最终相对比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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