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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全DNA组低宽度重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是采取较低宽度(~1×)的重测序参数去遗传性遗传性DNA遗传性基因变异遗传性DNA分型,在这之后可DNA型插入,将低溶解度参数插入为高溶解度DNA型参数。LcWGS 不能不程序发展,测序生产成本费用较低,可修改全DNA组遗传性遗传性DNA遗传性基因变异,更有益于于大投资额样板的物理性质确定及 GS 繁育用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可可以获得全DNA组的基因遗传规律进化
  • 高性价比
    以越来越低的测序总成本较为低廉,获得了高硬度的标记图片,判断高设计,施工效率高
  • 大群体
    样本检测
    选于大受众的基因组型验测及研究探讨
  • 分型
    准确性高
    系统设计插入图像匹配,临床诊断更准确性多达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状精确定位及GS结论更
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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